Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms