Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO28Q9NVF7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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