Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms