Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms