Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPJQ9HC77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms