Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MIXL1Q9H2W2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms