Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BPESC1Q9GZL8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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