Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms