Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP74Q9C0B2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP74Q9C0B2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms