Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FOXQ1Q9C009 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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