Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTFDC1Q9BY42 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms