Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPOQ9BU64 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPOQ9BU64 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms