Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TIMM29Q9BSF4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TIMM29Q9BSF4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms