Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3R4Q99570 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3R4Q99570 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms