Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CICQ96RK0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CICQ96RK0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms