Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms