Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms