Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCANQ96GW7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms