Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX21Q969T3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms