Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHMTQ93088 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms