Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4DQ92854 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms