Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTPRUQ92729 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRUQ92729 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms