Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms