Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH4

NUP37, Nucleoporin Nup37, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP37Q8NFH4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP37Q8NFH4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms