Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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