Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKD1L3Q7Z443 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms