Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT28Q7Z3Y7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT28Q7Z3Y7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms