Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STRCQ7RTU9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms