Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
HECW1Q76N89 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HECW1Q76N89 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms