Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP34Q70CQ2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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