Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD6Q6ZV73 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms