Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPGS1Q6ZTW0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPGS1Q6ZTW0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms