Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOA5Q6Q788 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOA5Q6Q788 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms