Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF38BQ5VTL8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms