Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC39AQ5SRH9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms