Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM47AQ5JRC9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms