Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms