Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA8Q53HL2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms