Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IMPG1Q17R60 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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