Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B3Q16720 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B3Q16720 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms