Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPE65Q16518 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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