Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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