Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1CQ15572 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1CQ15572 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1CQ15572 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1CQ15572 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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