Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF13Q15543 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms