Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CD59-211ENST00000528987 3716 ntTSL 1 (best)6.44□□□□□ -1.386e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 CD59-212ENST00000533181 424 ntTSL 55.52□□□□□ -1.536e-7■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SEPT1-209ENST00000572252 1279 ntTSL 524.98■■□□□ 1.592e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SEPT1-210ENST00000573615 1616 ntTSL 522.02■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SEPT1-205ENST00000566517 1080 ntTSL 521.89■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 SEPT1-204ENST00000563957 2738 ntTSL 516.9■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 12.9
PCBP1Q15365 EFHD2-202ENST00000445566 899 ntTSL 521.37■■□□□ 1.012e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 ZC3H18-205ENST00000564341 387 ntTSL 515.43■□□□□ 0.064e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 ZC3H18-206ENST00000565583 1068 ntTSL 214.45□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 ZC3H18-208ENST00000566496 1949 ntTSL 213.64□□□□□ -0.234e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 219.63■□□□□ 0.735e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 SEMA4C-205ENST00000474420 2625 ntTSL 218.63■□□□□ 0.577e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 SEMA4C-204ENST00000467747 3371 ntTSL 214.27□□□□□ -0.137e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 SEMA4C-206ENST00000482925 3776 ntTSL 213□□□□□ -0.337e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.93e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 220.48■□□□□ 0.873e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 56.89□□□□□ -1.313e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.083e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 RETREG2-201ENST00000273048 2533 ntTSL 1 (best)23.68■■□□□ 1.389e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.789e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 RETREG2-202ENST00000420189 1781 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.279e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 WNK2-211ENST00000464625 557 ntTSL 412.78□□□□□ -0.369e-9■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.343e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-7■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 FAM117A-202ENST00000503573 776 ntTSL 512.09□□□□□ -0.471e-6■■□□□ 12.8
PCBP1Q15365 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)31.26■■■□□ 2.66e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 XIAP-203ENST00000422098 390 ntTSL 426.1■■□□□ 1.776e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 224.36■■□□□ 1.496e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.436e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-215ENST00000636646 2151 ntTSL 523.79■■□□□ 1.46e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-212ENST00000636089 2230 ntTSL 523.35■■□□□ 1.336e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-201ENST00000463721 1836 ntTSL 223.34■■□□□ 1.336e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-219ENST00000636942 1696 ntTSL 523.25■■□□□ 1.316e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.26e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 XIAP-207ENST00000468691 764 ntTSL 521.58■■□□□ 1.056e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-226ENST00000637696 2373 ntTSL 521.23■□□□□ 0.996e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.996e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.976e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-208ENST00000635951 2168 ntTSL 521.03■□□□□ 0.966e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.96e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 XIAP-210ENST00000497640 533 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.856e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.846e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-217ENST00000636718 2499 ntTSL 520.29■□□□□ 0.846e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.826e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 HDAC7-213ENST00000440293 580 ntTSL 419.99■□□□□ 0.796e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 HDAC7-212ENST00000434070 645 ntTSL 419.77■□□□□ 0.766e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-207ENST00000635946 2459 ntTSL 519.6■□□□□ 0.736e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.656e-12■■□□□ 12.7
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PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-225ENST00000637563 2622 ntTSL 518.96■□□□□ 0.636e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-229ENST00000637978 1758 ntAPPRIS P5 TSL 518.7■□□□□ 0.586e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.526e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.56e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-213ENST00000635941 1691 ntTSL 518.15■□□□□ 0.56e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-221ENST00000637199 790 ntTSL 218.1■□□□□ 0.496e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-209ENST00000491318 1390 ntTSL 317.81■□□□□ 0.446e-7■■□□□ 12.7
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PCBP1Q15365 SUPT5H-208ENST00000595368 659 ntTSL 217.61■□□□□ 0.416e-7■■□□□ 12.7
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PCBP1Q15365 HDAC7-207ENST00000422254 593 ntTSL 417.41■□□□□ 0.386e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 GSE1-214ENST00000574293 777 ntTSL 317.23■□□□□ 0.356e-7■■□□□ 12.7
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PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-224ENST00000637512 1536 ntTSL 516.93■□□□□ 0.36e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 XIAP-208ENST00000481776 598 ntTSL 516.84■□□□□ 0.296e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-229ENST00000638136 1857 ntTSL 516.69■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-206ENST00000635937 3078 ntTSL 516.65■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-208ENST00000463092 968 ntTSL 216.38■□□□□ 0.216e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 CAPG-210ENST00000453973 452 ntTSL 316.34■□□□□ 0.216e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.111e-15■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-221ENST00000637130 3158 ntTSL 515.69■□□□□ 0.16e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-205ENST00000460906 820 ntTSL 515.14■□□□□ 0.016e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-218ENST00000491773 676 ntTSL 214.95□□□□□ -0.026e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 SUPT5H-220ENST00000601978 538 ntTSL 214.95□□□□□ -0.026e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-208ENST00000490244 812 ntTSL 214.75□□□□□ -0.056e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 HDAC7-215ENST00000447463 555 ntTSL 414.72□□□□□ -0.056e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-214ENST00000636490 3067 ntTSL 514.71□□□□□ -0.066e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-227ENST00000637730 2735 ntTSL 514.68□□□□□ -0.066e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-214ENST00000478467 857 ntTSL 314.42□□□□□ -0.16e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-213ENST00000473012 632 ntTSL 313.86□□□□□ -0.196e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-207ENST00000462688 901 ntTSL 513.79□□□□□ -0.26e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ABHD14A-ACY1-228ENST00000637778 3628 ntTSL 513.73□□□□□ -0.216e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-220ENST00000637149 386 ntTSL 313.53□□□□□ -0.246e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.296e-12■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-215ENST00000486699 968 ntTSL 312.9□□□□□ -0.346e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-211ENST00000469548 1044 ntTSL 212.82□□□□□ -0.366e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-203ENST00000434478 600 ntTSL 312.47□□□□□ -0.416e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-220ENST00000496439 800 ntTSL 212.42□□□□□ -0.426e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-217ENST00000491300 884 ntTSL 512.34□□□□□ -0.436e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ZNF207-201ENST00000321233 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.516e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 AC139887.2-203ENST00000503185 618 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.556e-12■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 AC139887.2-204ENST00000503405 550 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.556e-12■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-216ENST00000490385 860 ntTSL 511.31□□□□□ -0.66e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 UROD-202ENST00000428106 682 ntTSL 310.94□□□□□ -0.666e-7■■□□□ 12.7
PCBP1Q15365 ACY1-227ENST00000638077 456 ntTSL 210.39□□□□□ -0.756e-7■■□□□ 12.7
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