Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERBB4Q15303 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERBB4Q15303 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms