Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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