Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIXQ14938 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIXQ14938 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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