Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP1BQ14684 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RRP1BQ14684 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms