Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.413e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-211ENST00000578820 625 ntTSL 312.21□□□□□ -0.453e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.53e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-204ENST00000392482 1165 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.523e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-227ENST00000583894 712 ntTSL 211.49□□□□□ -0.573e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 510.96□□□□□ -0.663e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-208ENST00000543307 1003 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.663e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-204ENST00000392219 872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-201ENST00000379786 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 510.78□□□□□ -0.683e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-205ENST00000423817 892 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.763e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-209ENST00000586925 429 ntTSL 310.25□□□□□ -0.773e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-212ENST00000591716 682 ntTSL 310.25□□□□□ -0.773e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 NARF-222ENST00000583908 430 ntTSL 39.99□□□□□ -0.813e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 ISYNA1-207ENST00000581672 793 ntTSL 29.85□□□□□ -0.833e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-213ENST00000579996 820 ntTSL 29.62□□□□□ -0.873e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-210ENST00000588699 927 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.893e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-211ENST00000590686 862 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.933e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-202ENST00000392217 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.973e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-210ENST00000551003 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.983e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.993e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-206ENST00000549135 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.993e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.993e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -13e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 27.74□□□□□ -1.173e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FXYD5-213ENST00000592290 883 ntTSL 37.66□□□□□ -1.183e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-204ENST00000577787 838 ntTSL 27.5□□□□□ -1.213e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-230ENST00000584549 807 ntTSL 27.5□□□□□ -1.213e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-208ENST00000578491 463 ntTSL 27.45□□□□□ -1.223e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.293e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 TPD52L1-215ENST00000534368 684 ntTSL 36.85□□□□□ -1.313e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 DDX5-212ENST00000579461 814 ntTSL 35.78□□□□□ -1.483e-9■□□□□ 9.2
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PUM1Q14671 DDX5-222ENST00000583201 556 ntTSL 23.59□□□□□ -1.833e-9■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.564e-52■□□□□ 9.2
PUM1Q14671 STMN1-205ENST00000446334 665 ntTSL 26.36□□□□□ -1.399e-67■□□□□ 9.1
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PUM1Q14671 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 59.29□□□□□ -0.921e-20■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.339e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.399e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.469e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.989e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HADHA-203ENST00000471743 690 ntTSL 57.64□□□□□ -1.199e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 TMCO3-206ENST00000473287 459 ntTSL 26.2□□□□□ -1.429e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.479e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.649e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SLU7-207ENST00000521320 492 ntTSL 24.76□□□□□ -1.659e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 ARF1-208ENST00000478336 930 ntTSL 224.15■■□□□ 1.463e-32■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 ARF1-203ENST00000470558 820 ntTSL 215.71■□□□□ 0.113e-32■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 ARF1-204ENST00000470670 712 ntTSL 314.54□□□□□ -0.083e-32■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-11■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-219ENST00000456808 741 ntTSL 416.63■□□□□ 0.258e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-208ENST00000411953 582 ntTSL 515.7■□□□□ 0.18e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-213ENST00000430778 566 ntTSL 512.66□□□□□ -0.388e-8■□□□□ 9.1
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PUM1Q14671 SNRPA-211ENST00000601545 695 ntTSL 522.02■■□□□ 1.123e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SNRPA-204ENST00000598452 679 ntTSL 220.32■□□□□ 0.843e-6■□□□□ 9.1
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PUM1Q14671 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.653e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SNRPA-210ENST00000601393 969 ntTSL 317.05■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SNRPA-207ENST00000599570 925 ntTSL 313.82□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SNRPA-208ENST00000600456 592 ntTSL 313.78□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SNRPA-209ENST00000601253 519 ntTSL 313.78□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.848e-15■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 59.6□□□□□ -0.871e-20■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-18■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.352e-18■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.672e-18■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.035e-24■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.496e-16■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.926e-16■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.996e-16■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 TCERG1-215ENST00000515203 576 ntTSL 56.93□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 TCERG1-209ENST00000509810 784 ntTSL 25.53□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 NARF-225ENST00000584445 2484 ntTSL 211.25□□□□□ -0.611e-9■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 NARF-226ENST00000584513 500 ntTSL 310.75□□□□□ -0.691e-9■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 NARF-227ENST00000584965 300 ntTSL 39.2□□□□□ -0.941e-9■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPUL1-217ENST00000600596 581 ntTSL 510.77□□□□□ -0.692e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 GRB2-209ENST00000581959 359 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 MCM7-208ENST00000467516 776 ntTSL 211.53□□□□□ -0.566e-9■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.359e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 216.41■□□□□ 0.222e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 STK11-204ENST00000585851 505 ntTSL 314.82□□□□□ -0.049e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 STK11-207ENST00000589152 3365 ntTSL 214.7□□□□□ -0.069e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 STK11-209ENST00000593219 637 ntTSL 314.42□□□□□ -0.19e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HYOU1-208ENST00000531682 319 ntTSL 212.41□□□□□ -0.422e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPLL-211ENST00000498516 655 ntTSL 324.56■■□□□ 1.527e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.717e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.77e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.617e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.247e-12■□□□□ 9.1
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